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我国科学家构建出花生全基因组变异图谱

特征特性:

  科技日报广州2月27日电 (记者叶青 通讯员邹文平)27日,记者从广东省农业科学院得悉,该院作物研讨所花生团队经过大规模的花生种质资源集体基因组重测序,构建出花生全基因组变异图谱,并阐明晰我国花生的引进与传达途径,提醒了花生遗传改进的分子机制。该研讨成果近来在线发表于《天然·遗传学》。

  花生是我国重要的油料和经济作物之一。但是,受制于较低的基因组测序研讨水平,当时我国对花生基因组水平遗传变异及要害性状的遗传根底仍缺少系统解析,严峻限制了花生种质的改进及工业展开。

  “作物种质资源的立异与使用,是当时和未来作物遗传改进最重要的内容。”论文榜首作者、广东省农业科学院作物研讨所花生研讨室主任鲁清说,2019年,研讨团队真实开端发动花生大规模种质资源的全基因组重测序项目。

  研讨团队筛选出390份代表性的中心花生种质,对其进行重测序,构建了一张包括880万个单核苷酸多态性的花生全基因组变异图谱。研讨人员对28个重要农艺性状进行了全基因组相关剖析,取得了上万个显著性相关位点。经过候选基因剖析,研讨人员发掘到调控花生株型和含油量的新基因,为分子育种供给优异基因资源。

  “含油量相关新基因的发掘是花生研讨的重要方向。找到调控花生含油量的要害基因,就找到了培养高产高油新种类的‘钥匙’。”鲁清介绍,从全基因组层面、从数百万个变异位点中进行大规模样本的归纳解析,这在该研讨范畴尚属初次。

  起源于南美洲的花生是怎样来引进我国并广泛传达的呢?“咱们经过系统发育和种群结构剖析,开始证明了我国花生引进后,别离形成了以华北和珠江流域为中心区域的两大培养中心,且两个首要花生产区在长时间育种过程中频频进行基因交流,形成了我国丰厚的花生基因资源库。”研讨团队首席科学家梁炫强介绍,研讨标明,我国北方地区花生类群的基因流大多数来源于北美,而我国南边的花生则是从南亚和东南亚搬迁而来,这也开始印证了多个农史材料的定论。

  此外,研讨团队还经过对南边产区经典系谱11个种类测序,判定到2064个在育种中保存的中心基因模块,解析了我国南边花生遗传改进的分子遗传机制。

  “该研讨提出了深化了解花生遗传多样性和传达演化进程的重要头绪,为全球花生的遗传改进和育种战略的优化供给了重要的遗传资源。”研讨团队学科带头人陈小平泄漏,下一步将展开花生泛基因组研讨,发掘新的基因资源。一起,根据取得的基因组要害成果,开发花生高效的分子育种技能系统,树立花生基因/基因组规划育种,实现从基因组的理论打破到遗传育种的实践使用。


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我国科学家构建出花生全基因组变异图谱

特征特性:

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  花生是我国重要的油料和经济作物之一。但是,受制于较低的基因组测序研讨水平,当时我国对花生基因组水平遗传变异及要害性状的遗传根底仍缺少系统解析,严峻限制了花生种质的改进及工业展开。

  “作物种质资源的立异与使用,是当时和未来作物遗传改进最重要的内容。”论文榜首作者、广东省农业科学院作物研讨所花生研讨室主任鲁清说,2019年,研讨团队真实开端发动花生大规模种质资源的全基因组重测序项目。

  研讨团队筛选出390份代表性的中心花生种质,对其进行重测序,构建了一张包括880万个单核苷酸多态性的花生全基因组变异图谱。研讨人员对28个重要农艺性状进行了全基因组相关剖析,取得了上万个显著性相关位点。经过候选基因剖析,研讨人员发掘到调控花生株型和含油量的新基因,为分子育种供给优异基因资源。

  “含油量相关新基因的发掘是花生研讨的重要方向。找到调控花生含油量的要害基因,就找到了培养高产高油新种类的‘钥匙’。”鲁清介绍,从全基因组层面、从数百万个变异位点中进行大规模样本的归纳解析,这在该研讨范畴尚属初次。

  起源于南美洲的花生是怎样来引进我国并广泛传达的呢?“咱们经过系统发育和种群结构剖析,开始证明了我国花生引进后,别离形成了以华北和珠江流域为中心区域的两大培养中心,且两个首要花生产区在长时间育种过程中频频进行基因交流,形成了我国丰厚的花生基因资源库。”研讨团队首席科学家梁炫强介绍,研讨标明,我国北方地区花生类群的基因流大多数来源于北美,而我国南边的花生则是从南亚和东南亚搬迁而来,这也开始印证了多个农史材料的定论。

  此外,研讨团队还经过对南边产区经典系谱11个种类测序,判定到2064个在育种中保存的中心基因模块,解析了我国南边花生遗传改进的分子遗传机制。

  “该研讨提出了深化了解花生遗传多样性和传达演化进程的重要头绪,为全球花生的遗传改进和育种战略的优化供给了重要的遗传资源。”研讨团队学科带头人陈小平泄漏,下一步将展开花生泛基因组研讨,发掘新的基因资源。一起,根据取得的基因组要害成果,开发花生高效的分子育种技能系统,树立花生基因/基因组规划育种,实现从基因组的理论打破到遗传育种的实践使用。